根据对微生物控制的程度，可分为开放系统、屏障系统和隔离系统3类。开放系统饲养普通动物;屏障系统饲养无特定病原动物（SPF动物）；隔离系统饲养无菌动物及悉生动物。各类
实验动物房的环境条件和管理要选址和建筑设计实验动物房应建在环境清洁安静，地势高燥，排水、通风良好，水、电供应有保障的地方。尽量远离工厂、繁华居民区、屠宰厂、畜禽场，以及有疫源威胁和公害污染的地区。生产和科研单位的动物房宜单独建筑在一个小区内，与其他部门隔离。
实验动物房一般由饲养室、健康观察室、隔离检疫室、各种实验室（外科手术、实验处理解剖、术后管理、疾病诊断、治疗、生理生化检查、微生物检疫、饲料营养分析和特殊饲料的调制室等），以及贮藏室、清洁准备室、洗涤消毒室、工作人员用房（包括办公室、淋浴室、更衣室等）、走廊(清洁区和污染区)、废弃物处理设施、机房和变电所等组成。其平面布置，应使人、动物和物品的流动路线合理，作业方便。严格区分清洁区域和污染区域，以保证人和动物的健康，确保实验的准确性（人、动物和物品的流动路线见图）。饲养室的平面尺寸根据饲养量、饲养方式，笼具架规格、排列方式、室内环境、饲养管理及操作方式等综合研究确定。为了避免温、湿度在垂直方向出现梯度,笼架高度不宜超过1.8米,顶棚高应在2.2～3米范围内。走廊宽度要便于操作和搬运物料及器材,以不小于1.3米为宜。清洁准备室的大小,须根据作业内容和消毒灭菌装置等设施占用的空间确定。清洁准备室、清洁走廊同洗涤室以墙壁隔开，墙壁绝不允许出现裂缝。地面要平而不滑，不渗水、不漏水、耐药液腐蚀和耐磨损。对环境要求严格的房间，还要考虑选择发尘低的材料。墙地交角应圆滑无棱角。内墙壁应平滑、耐水、耐磨、耐消毒液腐蚀。墙与墙、墙与顶棚或梁的夹角应圆滑无棱角。顶棚一般不承受压力，使用涂有防水材料的薄水泥板，能经受水冲和消毒水腐蚀。饲养室通常不设外窗，饲养室之间也不设内窗，以避免干扰。饲养室的门，宜采用铝合金密封门，开启方向须注意室内外压差。屏障与非屏障之间的门，应设置非满足一定条件不能开启的装置。
木结构一般只作为简易的临时建筑；混合结构多为单层建筑。钢筋混领土框架结构的整体性好,变形小,宜在多层建筑中采用。钢骨架、用镀锌波纹金属板、内镶聚苯乙烯硬泡沫塑料板做保温层的围护结构具有较好的气密保温性能。
